食用菌工廠化每天都會產(chǎn)生大量出過菇的廢料（俗稱菌糠），這些廢料如何處理，是必須要解決的問題，一個日產(chǎn)10噸鮮菇的工廠，一天要產(chǎn)生20噸（含水量55%）左右的廢料。這些廢料如果處理得當(dāng)，不但能避免環(huán)境污染，也能產(chǎn)生很大的經(jīng)濟效益。
1、廢料栽培食用菌
食用菌工廠化生產(chǎn)只出一潮菇，而且為了保證產(chǎn)量，配方營養(yǎng)都很豐富，最后出完菇后的廢料仍有大量的營養(yǎng)沒有轉(zhuǎn)化完全，在這些廢料的基礎(chǔ)上添加30%左右的新料，可以栽培平菇、雞腿菇等食用菌。
2、生產(chǎn)有機肥
食用菌工廠化生產(chǎn)產(chǎn)生的廢料含有豐富的粗纖維和粗蛋白，添加適量雞糞、豬糞等很容易發(fā)酵，是制作有機肥的很好的原料，用食用菌廢料能夠生產(chǎn)出符合國家標準的生物有機肥，菇行天下10年去山東、河南等地考察了很多有機肥設(shè)備廠家和用食用菌廢料生產(chǎn)有機肥的廠家，建設(shè)一條年產(chǎn)4000噸生物有機肥的生產(chǎn)線需要100萬元，產(chǎn)值可達數(shù)百萬元，經(jīng)濟效益十分可觀。
3、制作碳棒或者燃燒
食用菌工廠可以自己制作碳棒，也可以出售給制作碳棒的廠家，直接出售廢料的價格在50-100元/噸之間，也可以自己簡單處理，直接燃燒，用于滅菌或者供暖。
4、作為生物發(fā)電的燃料
可以出售給生物發(fā)電廠，價格比制作碳棒的價格要低一些。
5、作為蚯蚓養(yǎng)殖的基質(zhì)
食用菌廢料經(jīng)過發(fā)酵后是養(yǎng)殖蚯蚓的好基質(zhì)，這種方式的用量不大。
6、作為牛羊飼料
食用菌工廠化出菇后的廢料含有大量的菌體蛋白，粗纖維大部分被菌絲體分解，是牛羊等反芻動物的好飼料，可以直接飼喂，也可以烘干后制作成顆粒飼料。
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